Introdução: O Apoio institucional é uma ferramenta de suporte às ações de Saúde das equipes colocando-as no destaque de suas reflexões e das mudanças de seus processos de trabalho. Objetivo: Investigar o processo de Apoio Institucional realizado aos médicos de Ermelino Matarazzo, identificando suas percepções acerca do apoio institucional médico e contribuir com o processo assistencial local. Métodos: Através de questionários de pesquisa aplicados em onze unidades de Atenção Básica na zona leste de São Paulo obteve-se pela análise de conteúdo de Minayo a qualificação das impressões da equipe médica sobre o apoio institucional ofertados por médicos vinculados à administração direta e parceira da Prefeitura de São Paulo no território. Resultados: A equipe médica local elencou nos questionários de pesquisa como temas para a ampliação do Apoio Institucional recebido: a disponibilidade e o apoio/suporte. Também se obteve a caracterização da equipe médica local como sendo de profissionais mulheres, de vínculo celetista e atuantes nas Estratégias de Saúde da Família. Conclusões: O Apoio Institucional realizado por médicos e ofertados a essa categoria é uma realidade em Ermelino Matarazzo, necessitando vencer aos desafios do ajuste da prática médica dentro da reflexão contínua, via o ajuste de rotinas ao contrato de gestão vigente no município; transpondo o quantitativo assistencial preconizado, com a qualidade através da reflexão decorrente do Método Paidéia mediante o fortalecimento de canais de suporte e apoio técnico assistencial.